大同军曾与马士英联手围剿英霍山区的流寇，临走还在蕲州斩杀张献忠，与张献忠余部已成死敌，任由孙可望占据四川必是大患——大都督府非常清楚这一点，利用秋操的机会把侯世杰的步一镇、孙守法的步二镇、铁彪的步九镇调到汉中，把合赤烈的藏区和硕特骑兵调到打箭炉，提前做好出兵的准备，但因为议院没有通过出兵决议，粮饷、军械无法保障，大军迟迟不能展开行动。
说到底，议院还是舍不得钱，以孙庭耀为首的秦商答应出这笔军费，但提出条件——四川将自流井、贡井的盐和长江航道交给他们经营，四川巡抚龙文光和秦商反复讨价还价，好不容易达成协议，这帮家伙又开始耍赖，这件事一拖再拖，众议院直到十月底才通过出兵决议。军费有了着落，总统府立刻任命杨文岳为四川统领、龙文光为布政使、孙守法为提督军务、李国英为赞画军务，各路大军即刻启程，从北面、西面夹攻四川流贼。
这时，四川已打成一片糜烂，孙可望四月初沿长江大举进攻，大败明将秦良玉、曹英等人，攻取重镇重庆、泸州，随后挥军北上直驱CD，沿途所向披靡。南京朝廷也有所动作，辗转云贵传来诏书，授命王应熊以兵部尚书衔总督川湖云贵军务，并赐尚方宝剑——朝廷只字不提援兵、粮饷，却把麻烦塞给闲赋在家的王应熊，显然对争夺四川已无信心。
流贼一路顺风打到CD，川民苦于苛政久矣，听到流贼“蠲免三年租税”的口号便争相投顺，CD在八月初失陷，蜀王及前四川巡抚陈士奇等一批宗室、高官被擒杀。
王应熊从大同赶往巴县老家，在路上接到诏书，老家伙对朝廷的信任感激涕零，决心以身报国，还没弄清楚战况如何便下令四川各地官军赶赴CD与贼决一死战。这时候哪还有多少官军呀，各地只好驱赶百姓凑数，这支乌合之众还没到CD，便被流贼打得溃不成军，王应熊无力回天，带着参将杨展、曾英等人的残部逃往顺庆。
孙可望如愿以偿夺取CD，屁股还没坐热，不料背后又钻出个马科，这家伙打着大顺的旗号攻占夔州后奔袭重庆，留守川东的流贼大将艾能奇措手不及，被打得落荒而逃，重庆告急，孙可望只好暂时放过王应熊，回过头去打马科。
马科兵少不敢硬打，发现贼军主力扑来，马上逃向汉中，途经顺庆与王应熊的残兵相遇，双方都打起坏主意——马科的队伍不足万人，但老底子是山海关边军，战力绝对不差，王应熊有心收为己用，派人劝说马科反正听从他老人家号令，以前投降李自成的事既往不咎，马科同样有心扩充队伍，眼前这支残军最好下手，转眼便打出大同联邦楚军第二镇的旗号，勒令王应熊的残兵接受改编。王应熊气得暴跳如雷，下令杨展、曾英剿贼，结果这两个宝贝不是马科的对手，三万川军一败涂地，被俘的三千人被马科强行收编。
王应熊惹不起马科，便厚着脸皮向保宁、绥定紧急求援，秦翼明、马祥麟自然要帮川人，迅速起兵增援，不过意外的是贺珍的汉中兵也突然出现——贺珍在蛮汉山武选学堂受训半年多，洗脑彻底表现优异，被授予副将上品军阶，晋升汉中府、兴安直隶州守备，这家伙自以为贴上大同军嫡系的标签，立功心切抢下大同军进川先锋的差事，昼夜行军到达顺庆。这下乱套了，贺珍与秦翼明、马祥麟都打大同的旗号，但陕西人向着陕西人，四川人向着四川人，贺珍与马科合兵一处要欺负打明军旗号的川军，秦翼明、马祥麟也与王应熊联手向马科讨公道，大敌当前，川军与秦军居然要闹内讧。不过，双方还没大打出手就被迫收场——杨文岳率领大同军主力及时赶到，川军还没作出反应就被孙守法、侯世杰两个镇包围缴械，王应熊见势不妙马上装出一副理直气壮的样子找杨文岳理论。
“老夫乃大同联邦参议官也，你杨斗望敢图谋友军，不怕参议院弹劾吗！”王应熊使劲挥舞一封公文，心里却在暗骂，你大同倒是早点出兵呀，害得老子白为那个不争气的朝廷效忠一回，好在还来得及，又抬手一指贺珍、马科怒喝，“这两个不肖之徒都有投降闯贼的前科，暗通孙贼也未可知，还不拿下查办！”
“王大嘴，你才是脚踩两条船居心叵测。”贺珍、马科立刻跳起来指着王应熊大喊。
“误会，误会，都一家人，大敌当前，还是要同心协力剿灭贼寇。”杨文岳在总统府协理政务，什么底细都知道，贺珍是总统为降将树立的榜样，今后准有前途，马科与总统有旧交，暗中早已投靠大同，相比之下王应熊反而有些不光彩——总统府确实发出公文邀请一些前朝高官进参议院，贺逢圣欣然接受，但他王大嘴始终不表态，给亲民党惹了祸还一走了之，如今打着大明的旗号却自称是联邦参议官，这算什么人呀，算了，看在四川老乡的份上，就不揭穿他了。
王应熊哼了一声，向杨文岳一伸手：“既然是一家人，我的兵也是大同军，你马上把人放了，给我粮饷、军械。”
“不行，川军不过是一帮拿锄头、棍棒的老百姓，上了战场反而误事，必须马上遣散。”孙守法冷冷地答道。
“粮食还不够我们吃呢，哪顾得到你们这帮乌合之众。”侯世杰也随声附和。
王应熊又要发怒，杨文岳朝他摆摆手，一脸为难地说道：“老大人，我也没办法呀，进川的路不好走，粮草辎重还在后面，楚军和川军加起来有四万人，我哪养得起呀！这样吧，我也该为乡亲做点事，你们帮着修路搭桥、运送辎重吧，干一天管一天饭，不愿干的自己回家。”
四川已是一片糜烂，回家未必有活路，能有碗饭吃够幸运了——王应熊很无奈地带着他那帮兵干起了杂活，大同军突然添了四万张嘴，粮食不够吃，被迫就地休整等待后面的李国英、铁彪把粮草送上来，幸运的是流贼没有杀过来，白白浪费了这个大好战机。
孙可望在CD正忙着呢，流贼沿途裹挟数十万人，吃饭就是大难题，原以为进了CD会有好日子过，但没想到官库里空空荡荡也没多少钱粮——辛苦一趟却得不到实惠，贼头们怨声载道，孙可望急红了眼，“蠲免三年租税”去他妈的吧，先抢够了再说，谁敢不从立刻杀头。
流贼恢复了本性，不分穷家富户一律抢光，青壮男女也要绑至营中效力，川人忍无可忍，在士绅带领下奋起反抗，但马上招来更凶残的屠杀，流贼所到之处人烟皆无、血腥遍地。孙可望杀人无数还觉得不够狠，干爹张献忠教过重刑立威的道理，这家伙又用起了炮烙、凌迟之刑，看谁不顺眼就酷刑处死。眼见抢来的财物越来越多、身边的人也越来越恭顺，孙可望像打了鸡血一般兴奋，也想过一把皇帝瘾，找来一帮文人鼓捣起建国大业，川北那点小事还顾不上，不就是一帮明军捣乱吗，随便派个人剿灭就行了。
十一月上，孙可望在CD建“大西国”，自立为大西皇帝，这是他最得意的一天，随后就接到噩耗，派去川北的大将刘进忠携三万之众在顺庆投敌，对手并不是明军，而是杀他干爹的大同军——死对头来了，这可是煞星啊，孙可望吓得倒吸凉气，躲是躲不过去了，索性破釜沉舟决一死战，我有几十万大军，撑也能把他们撑死。
孙可望拿定主意立刻下令屠城，CD城内外又是血雨腥风一片——这家伙恶贯满盈，深知川人恨他入骨，只要他一走就会造反，索性杀到底吧，自古帝王哪个不是心狠手辣！杀完人后，孙可望觉得放心了，满身血腥味率领大西军浩浩荡荡扑向顺庆。
孙可望出兵还是晚了一步，就在他疯狂屠城之际，李国英、铁彪押送粮草辎重赶到顺庆，大同军得到补充立刻起兵，在西充与大西军迎头相撞。大同骑兵优势明显，首先发现了对手，贺珍毫不犹豫带领汉中兵发起攻击，紧接着马科、马祥麟也率部投入战斗，大西军不甘示弱，先锋大将马元利身先士卒带领骑兵反击，但对面射来的铳子、箭矢密如雨点，大西军骑兵纷纷落马，马元利自己也被抬铳击中，大西军的前锋部队失去主将，坚持了没多久便崩溃。
孙可望得到战报大吃一惊，立刻下令抢占附近的凤凰山，据险而守与敌对峙，同时催促后面的部队赶来会合。大同军追杀败兵到达凤凰山下，发现山上密密麻麻都是大西军，也不敢轻易向山上攻，停止前进等候命令。
杨文岳、孙守法领着一帮将领很快到了前沿，各自举起千里眼观察了一阵，然后纷纷摇头——大西军人数太多，把整座山守得密不透风，三座石门寨架满了铳炮弓弩，死死堵住进山的道路。
“孙贼绰号‘一堵墙’，长于死守恶战，他是想诱我消耗兵力，以便伺机反攻，诸位大人切不可上当。”大西军降将刘进忠提醒道，这家伙原是马守应的人，不属于孙可望的嫡系，别人在CD作威作福，他却被派往川北，还很倒霉在顺庆突遇强敌，打又打不过，逃又逃不掉，索性率部临阵投降，孙可法也不客气，把他的部队强行拆散充作打杂的辅兵，光棍一个出去就是死，他只好死心塌地跟大同军混了。
孙守法点点头：“我军可战之兵不过五万，又不擅攻坚，以寡敌众未必能攻击得手，必须想一条妙计。”
“老马，你偷袭过流贼，孙贼肯定怀恨在心，你去诱他下山，我的步一镇办剩下的事。”侯世杰指着马科说道。
“我倒是可以去诱敌，但这家伙是老贼，未必肯上当。”马科摇了摇头。
“没那么麻烦，派人断其后路，并以骑兵困住贼人，把各部的千斤行营炮都调上来，对着石门寨使劲轰，打出缺口就派选锋兵冲，我们一点一点往上拱，看贼人怎么办，我大清先帝爷就是用这一手攻下了大凌河、锦州。”鳌拜被孙可法从飞虎营借来训练骑兵，这回跟着步二镇一块入川，见大家说得热闹，也操着半生不熟的晋北话出主意。
“什么大清先帝爷，建酋而已罢了，鳌拜，你到底吃的是哪家的饭？”王应熊听着刺耳，马上高声喝道。
“连我哥都称大清先帝为义父，你王大嘴竟敢不敬。”鳌拜火了，一把揪住王应熊的衣领。
“鳌拜，别动手，都是自己人，”李国英一把抱住鳌拜，众将也赶忙过来把王应熊拉开。
“好了，别再闹了，我看鳌拜小将军的主意不错，就这么办吧。”杨文岳使劲摆摆手，然后拉着王应熊走了。
“马科、贺珍，你们两个绕过凤凰山断其后路，鳌拜指挥各镇骑兵封锁流贼，火炮、火铳都调上来给我狠狠打。”孙守法对众将下达命令，这是老规矩，打不打文官说了算，怎么打武将说了算。
第二天蒙蒙亮，凤凰山下炮声隆隆、硝烟弥漫——大同军的火炮攻击开始了，六七十尊千斤行营炮分成三队反复轰击三座石门寨，数百面阵墙也在山前树立起来，臼炮、火铳躲在后面不停地射击。大西军马上以铳炮还击，但这些明军用过的破铜烂铁太不给力，准头差、射程短吓不住对手，容易炸膛的老毛病还让自己人吃到苦头，还击很快变得有气无力，最后干脆停下来，任由对方压着打。
挨打的滋味不好受，尤其是对方射来的开花弹最吓人，一炸一大片，大西军中大多数是被裹胁来的农夫，这些人没有盔甲，挨了炸疼得满地打滚，其他人看着心惊肉跳，听到炮声就拔腿跑，大西军的防御出现混乱——前方情况不妙，孙可望并不惊慌，他身经百战很清楚火器的杀伤力有限，防守不利主要是因为那些老百姓被火炮吓破胆乱跑，多派些悍匪弹压就行了，大西军有的是人，不在乎多杀几个逃兵。
大同军很有钱吗，火炮打起来没完没了，照这样打下去，那三座山民用石头砌出来的石门寨可能撑不了多久——孙可望听着炮声心里有些烦躁，他不怕大同军攻山，但火器对射消耗太大，大西军打不起这种仗。
这一天，大同军的火炮反复响起，入夜后也没停止，孙可望不敢大意，彻夜守在中军大帐，天快亮时才打了个盹，等他醒来时，亲兵送来紧急军报——大同军绕道山后发动突袭，烧毁嘉陵江上百余条运粮船只，白文选、冯双礼两位将军也被敌纠缠无法脱身，暂时不能赶到凤凰山。
白文选、冯双礼怂货，手里握有十几万人却丧失粮草，这两个人一定是心怀不满，有意贻误战机，寡人饶不了他们——孙可望气得暴跳如雷，却忘了大西军精锐都在他手中，白文选、冯双礼手下几乎都是些老百姓。
紧接着又有亲兵来报，东面的石门寨被轰塌了，大同军正在向寨子里冲——孙可望再也沉不住气了，一脚踹翻亲兵，抓起桌上的大刀冲出大帐。
攻击东面的石门寨是秦翼明、马祥麟的保宁、绥定两府民兵——这些川兵打山地战确实在行，寨墙刚被轰塌，营官马虎头便带领五百石砫选锋兵顺着缺口爬上寨墙。大同军的火炮连续轰击一天一夜，贼兵已是惊弓之鸟，打了不多时就被赶下寨墙，贼头打红了眼，扑向领头的马虎头，两人交手几个回合，贼头力气不加被踹翻在地，随即人头落地。马祥麟抓住战机，带领两千民兵尾随马虎头冲入寨内，贼众再受重击无心恋战，或降或逃彻底崩溃，寨子被一举攻占。
马虎头得手后继续向山上攻，但山间道路又窄又陡，一面临山一面深沟，贼人居高临下不断射箭打铳、投掷石块，石砫选锋兵几次攻击都被打回来，马虎头还差点被石头砸死。马祥麟见状下令调虎蹲炮、步铳掩护，马虎头缓过劲又带人一点一点向上拱，攻克一道山梁后累得筋疲力尽，贼人趁机反击，但也被铳炮击退，双方在狭窄的山路上都无法展开兵力，互相对射相持不下。
东石门寨失守震惊了孙可望，对方用蚂蚁啃骨头的办法往山上拱，虽然慢但有效果，也许另两座寨子也即将失守，山上虽有十万人马，但白文选、冯双礼两个混蛋送不来粮食，如此被动打下去必定一败涂地，不能再犹豫了，必须主动出击——孙可望想明白道理，立刻率领三万精锐出了北石门寨，向大同军突然发起攻击。
