朱武、公孙胜二人遍翻史籍，总结历朝历代的征兵募兵的办法，又结合了梁山军这一路走来所使用过的办法，以及梁山军能不能够如臂使指的使用等条件，再加上祝彪的提点，最后创立了一套新的兵制，这套制度称之为卫所制。
其实卫所制也不是祝彪所创立，略微有一点历史常识的人都制度，真正首创卫所制的是明太祖朱元璋。祝彪不过是剽窃而已。这套卫所制在明朝的初期起到了稳固明朝政权的重要作用，至于这套制度，在明朝末年成了腐败的窝点，那不能说是这套制度不好。首先要知道，任何制度都是人制定的，执行制度的也是人。就好比一把枪，在好人手里，它可以保护好人的生命财产安全，在坏人手里，就成了杀人抢劫的凶器。
卫所制的兵源一共有四种：第一种，旧部，即梁山旧有的军马，这是梁山军嫡系中的嫡系；第二种，归附，包括投降的宋军和削平群雄所得的军马，这其中当然包括王庆和方腊的旧部；第三种，恩军，既在原梁山特别行政区中的犯人，这些犯人多是死囚，两军交锋之时，让他们打头阵；第四种，垛集，即征兵，按人口比例，一家有五丁或三丁出一丁为军。前两种其实是梁山军已经有了的军马，后两者则是补充兵力，特别是垛集，在数量是行占了很大的比例。
制定了招募兵马的方法，梁山军立刻照此施行，很快，梁山军由原来的二十七八万人一下子扩充到了四十余万人上下，增加了十余万人。
征兵的问题解决了，下一步就是要建设这个可以说是初创的政权。如今祝彪最为缺少的不是马上得天下的武将，而是马下治天下的文官。
过去如果说祝彪开科取士还有一些避讳的话，那如今的祝彪已然没有任何避讳了，他可以以大宋王朝中央政府的名义名正言顺的公开的开科士子，可是关键的是这些录取士子是支持他祝彪还是支持赵宋，政治立场很难辨明。这件事看似无关紧要，其实很是要紧。这些录取的士子，日后都会在祝彪的政权中担任各种职务，上至中央各部，下至州县守牧，都是这班士子。想想，如果这班士子拥护赵宋，祝彪称帝会是什么结果？
最后还是朱武给祝彪出了个计策。就是在殿试的时候，让赵构出道试题，唤作《论曹操》，看录取的士子如何作答，从中就可以分辨出忠于祝彪和忠于赵宋的士子来，对于忠于祝彪的，那自然大力栽培，提拔重用，对于忠于赵宋的，那就旁敲侧击，着力打压，以图分化瓦解，对于其中识时务者，可以利用而决不能重用，而对于那些冥顽不灵者，可以保留一二，以示宽宏大量，其他的那就不用说了，该杀的杀，该贬的贬，斩草要除根。
就在祝彪忙着建设这个新政权的时候，忽然朱武奔到祝彪的相府之中，禀告说赵宋的成都府中书赵熙联结秦州知州折可存，起兵造反，要问拥立之罪。
祝彪一听这个消息哈哈大笑道：“好啊，好！老子正来了瞌睡，就有人给我送枕头来了。”
朱武道：“寨主，这西川未经战乱，又是天府之国，一旦让赵熙折可存这些宵小成了事，那可是要坏大事的。”
祝彪道：“军师，我们虽然拥立了赵构，可是真正我军能控制的州府，还是过去我们兄弟血拼下来的那些城池，没有太大的变化，今朝有人造反，我们正好打着大宋王朝的旗帜去剿灭他，一来可以就汤下面，乘势占了西川；二来也正好看看，这赵宋的旗帜好使不好使，如果不好使，那咱们就换了他，又有何不可啊？”
朱武沉思片刻道：“但是对于这次造反，不可大意，须得以狮子搏兔之力，一举剿灭。”
祝彪道：“军师说的有理，只要这一战打得好，从此我看天下谁敢不服！”
“正是正是，这是服天下之战啊！”
当下，祝彪下令屯驻鄂州的岳飞率领第二军团立刻入蜀，有令驻守在金陵附近的吴玠吴璘兄弟，率领一部分招募的新兵，配上行军司马和行军侍中以及部将，组成第五军团，入川支援岳飞征讨西川。
朱武又进言道：“寨主，在下有个建议，不知当讲不当讲。”
“都是自家弟兄，有话尽可说。”
朱武道：“现在我军当乘着赵宋的各处州县在观望蜀中战事的时候，立刻向各处进军，就算蜀中战事一时半会儿没个结果，我们也正好防着其他各处也谋反作乱。”
祝彪颔首道：“军师说得有理，但是我们手里必须留两个军团，以防不测。”
朱武想了想道：“小可有个主意，不知成也不成？”
祝彪道：“军师，你往日说话不似今朝这般拖泥带水，今天说起话来，怎么结结巴巴的。”
朱武立刻恭恭敬敬的道：“寨主，如今新皇登基，这各处州县的知县知州该来朝拜，才是正理。请寨主下道圣旨，将长江以南的官员全服召来金陵，然后该杀的不妨杀一批，该贬的也不妨贬一批，该升迁的不妨升迁一批，该然他们回去的不妨放回一批，来个大清洗，至于那些不愿来的，或以各种理由搪塞敷衍的，疑虑派兵剿灭，一个不留。”
朱武的话说完，祝彪看了他一眼：这神机军师看来是个心狠手辣的主啊。随即又问道：“那为什么只要长江以南的个州县的官员来呢？”
朱武道：“长江以北的，临近金人，逼得急了，他们就会反水，处理这些前朝的旧臣，要一批一批的来，不能急，急了就会出乱子，寨主现在要的稳，不是乱，无论大乱小乱，对于我军都是不利的。”
祝彪笑道：“军师啊，咱们梁山贼寇虽然是贼寇，但是就算是做贼寇，也得做个心胸宽广的贼寇，这般容不下人，那是不行的！不仅不能杀，只要不明目张胆的对抗朝廷，一个也不抓，就算真有敢冒天下之大不韪的，我们的原则也是是严惩恶首，胁从不问。”
朱武没有想到这回祝彪竟然会这般的宽容，先是一愣，随即答道：“遵命！”
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吴玠吴璘兄弟比岳飞先行接到祝彪的将令，他们知道自己兄弟扬名立万的时候到了，他们一接到军令，立刻率领第五军团，由扬州上船，浩浩荡荡沿江西上。
岳飞接了将令，在鄂州布置一番以后，然后便领着军马上船，往西川开拔。
